木叶查清封印室袭击案的主使者是大蛇丸残党。
日向启接到命令清除大蛇丸藏在木叶的内奸，捣毁隐藏在火之国的蛇窝。
日向启利用职务之便收获大量大蛇丸的血继实验资料与木遁实验资料等，使得鬼芽罗之术研究取得重大进展。
木叶54年1月9日阻截云隐商队
收获一名岚遁忍者尸体，成日向启偷偷隐下作为接下来的研究材料。
木叶54年2月13日协助木叶主攻部队击溃云隐攻势
战争进入也进入僵持阶段。
木叶54年3月26日带漩涡鸣人体检，收获漩涡一族仙人体新鲜血液。
研究鬼芽罗之术遇到瓶颈，无法萃取出完整的血继容易带出被施术者基因，会改变施术者相貌。
木叶54年5月17日监视宇智波动向
继续研究鬼芽罗之术
木叶54年7月3日庆祝宁次生日
改变研究方向，找到松尾清一学习医疗忍术，研究取得一定突破。
中间日向启做任务研究，时间一直行至最重要的一个节点。
木叶54年12月9日，前往雷之国给雷影送信，遭到四代雷影“热情”招呼的四人，让日向启见识到了他的雷遁查克拉模式。
回到木叶后日向启改良了雷忍体术·雷铠，获得了更快更强的速度。
并继续研究鬼芽罗之术。
木叶54年12月19日接受和谈，前往边境护送云隐和谈使团前往木叶，云隐为首的几人也都是日向启的“熟人”熔遁土台与雷影秘书麻布依，其他跟随成员都两名上忍五名中忍。
日向启放下手头的所有事情，准备应对日差姑夫的生死大劫。
日向启这些暗部全权接手了和谈时木叶的安全问题。
木叶54年12月27日当晚两村会谈
所有大族出席会议，而日向却因为大小姐的生辰原因缺席。
当晚拟定完条约，就在木叶所有人都沉浸在迎来和平的喜悦中时。
卡卡西小队就看到一名云忍鬼鬼祟祟的离开驻地，直奔欢庆过后沉寂下来的日向族地。
就在他翻入日向族地围墙后，小心潜入进日向族长院子中，趁着外面大人们的喝酒打闹的声音抱起已经熟睡的日向雏田，雏田被惊醒但被紧紧捂住嘴巴发不出一点声音。
云隐忍者原路翻出日向族地，就在他落地的一霎。
还要有下一步行动时，卡卡西，日向启天藏，雨淋四人手持手电筒同时出现在了那名忍者面前。
几束灯光同时打在那名云忍身上。
卡卡西手持出鞘直刀横在那人脖子上：“放下那个孩子，然后跟我去认罪伏法。”
云隐忍者反应也很快一下子把苦无架在雏田脖子上：“别乱动，乱动一下我就杀死她。”
当他看到一下子出现这么多的忍者，顿时就知道自己行迹败露时，他立马就拿起苦无就向着自己脖子刺去。
只要自己死了，土台大人的谋划一样可以完成！
日向启早有准备一瞬出现在了那人背后，封雷掌打出，瞬间把那云忍全身穴位封死。
云忍身体就像是一下失去了力气倒在地上，怀中三岁的雏田掉出被日向启轻松接住。
雨淋拿出将云忍五花大绑起来。
日向启看向天藏木分身的位置：“怎么样，天藏，都录上了么？”
木分身端着录像机摆出了一个ok的手势表示都已经录下来了。
“行，证据确凿，我们去找三代大人。”
日向启并没有心思把雏田送回去，自己的谋划已经完成，他把雏田放在地上拍了拍她身上的尘土。
“你自己回去吧，回去后就跟你父亲说是暗部救了你。”日向启对雏田还是挺有好感的，也不会把自己的怒火牵扯到一个孩子身上。
“嗯，我……我明白了。”
接着雏田一步三回头的向着日向族地门口走去。