由于灾难来得突然，无法精确地统计出此次地震水灾的死亡人数，根据事后统计，至少有数万人葬身。
从死亡原因上看，一是河水溢决堤岸之后，造成了对城市的直接侵入，使人溺水而亡。
如江苏省松江府大水入城，死者甚众；高邮北运河东堤上的险工清水潭被震坏，致使高邮环城水高二丈，漂溺人，死者数万。
其次地震引起了海啸，使滨海地区人民遇难。如苏沭阳地震之后，海水大涨；滨湖之家尽没。
其三是地震时由于江河之内的水体剧烈动荡，也使停泊在岸边的船只失去稳定，造成舟毁人亡的事件。如江苏丹徒、丹阳等地长江之水皆为鼓荡，停泊之舟多覆溺。
其四是淹没农田，毁坏庄稼。这次地震，洪水淹没了大面积的农田，毁坏了大批的庄稼。面对着洪水，人们在无居、无食的环境下，使本次地震的灾情进一步扩大。
如江苏清河地废人逃，邑治几废；冲没治后田庐数十里；水决三仪坝。山东即墨田禾淹没，民地泥涂；河南汝宁府洪水决，田禾淹没。
再有水利工程的破坏：华夏三十年修建的水利工程破坏殆尽。黄河是由开封、商丘以东，经虞城、曹、沛等县，于徐州南流，过宿迁，至清河与淮河、运河合流后东流入海。
黄、淮、运三河交汇之地称为清口，是漕船出入运河的咽喉。三仪坝就是设在清口的一个重要水利枢纽。
在这次地震时，三仪坝被震坏，运河在高邮、宝应多处溃决，这不仅造成了这些地方的下游水灾，而且影响到了航运。河北永年，江苏海州等地河流的堤防也有震坏。
此外，浙江海盐地区的海塘工程崩塌，除了海水的侵溢之外，还引起农田的盐碱化。
水害带来的后果是严重的。朝廷把地裂(陷)、喷水冒砂、水翻波斗的小规模的水灾称为水害。这次地震中，江苏淮安、邳县、连云港、海州、沭阳，山东汶上、郯城、莒县等多处地方都产生了这种水害。
如海州更加的惨烈，地裂处沙涌水飞，深者数十丈；郯城也遍地水流，沟浍皆盈，移时即消化为乌有。
此外，在这次地震中，江西九江江沸涌高七八尺；江苏南京、高淳水翻波斗，不可能不对沿江地带产生水害，甚至水灾。
根据事后统计，郯城、沂州、莒州三地死亡人数最高，有近三十万人遇难。
这场史无前例的大灾难，对朝廷官员也是一次巨大的考验。所有人都没有这方面的经验。
所幸的是太上皇和太皇太后赶到了京城。这夫妇俩亲自坐镇指挥全局，各个衙门抽调主官，组成的抗震救灾指挥部。
由于两位穿越者的介入，夫妻俩借鉴后世的经验，让这次救灾工作有序的开展起来。
朝廷的官员通过这次救灾，学到了不少的行政经验，一大批年轻有为的官员被提拔到领导岗位。同时也锻炼了队伍，为今后朝廷应急指挥打下了良好的基础。
灾难无情人有情，在太上皇”一方有难，八方支援”的号召下，一夜之间华夏人民空前的团结，纷纷向灾区伸出援助之手。
幸亏华夏帝国多年来风调雨顺，积累了大量的物质。同时从美洲和南洋紧急调运了大批的粮食，使得国内的粮价比较稳定，没有引起社会动荡。
同时救灾过程中，朝廷重拳出击。一批心怀叵测，妖言惑众，散布谣言的不法之徒被绳之以法。在朝廷强有力的打击下，社会风气也为之一正。
这次灾害，由于山东，江苏受灾严重。在朝廷政策的引导下，大批的受灾人民被迁往海外领地，改变了海外领地的人口结构。
事后根据户部资料统计，这次灾后大移民，共向美洲移二百六十万人口，南洋吕宋八十万，婆罗洲三十万。稳定了华夏在当地的统治。这些地方成了华夏自古以来不可分割的一部分。
整个华夏四十五年，朝廷的工作重心主要放在灾后重建。勤劳的华夏人民面对着如此严重的灾害，依然顽强的站立起来。
在朝廷的领导下，他们积极开展生产自救，重建自己的家园，截止到四十六年初，山东、江苏渐渐地从灾害中恢复过来，呈现出一派勃勃的生机。